Мутанти продовжують боротьбу проти суспільства, яке лякає їх, і якому вони не довіряють. Їхнє становище стає ще більш відчайдушним, коли вони зазнають потужної атаки невідомого супротивника, що володіє екстраординарними здібностями. Раптовий напад знову стає причиною політичного і громадського резонансу з приводу введення повсюдної реєстрації мутантів і причиною утворення руху проти мутантів, очолюваного Вільямом Страйкером, колишнім військовим, який, за чутками, проводив досліди над мутантами. Робота Страйкера була якимось чином пов'язана з таємничим минулим Логана, яке він не пам'ятає. Щойно Росомаха починає намагатися розгадати своє минуле, Страйкер активує свою програму, спрямовану проти мутантів, тобто організовує штурм на будинок професора Ксав'є. Магнето, який втік із пластикової в'язниці, пропонує Людям Ікс об'єднатися і битися разом проти їхнього спільного страхітливого ворога Страйкера. Цього разу Люди ІКС стикаються з найсерйознішим завданням, яке коли-небудь стояло перед ними: зараз у їхніх руках долі не тільки всіх мутантів, а й усього людства.